Le climat du désert d’Atacama est extrêmement sec avec des températures modérées et fraîches, avec une moyenne de 1 mm de précipitations chaque année. San Pedro de Atacama est à 2 407 m au-dessus du niveau de la mer. Les excursions peuvent atteindre 5 600 m. Les températures varient selon la saison, l’altitude et l’heure de la journée, avec des maximums de 32⁰C en été, et des minimums de -2⁰C en hiver. L’été amène également une augmentation de l’humidité, avec de possibles précipitations.